Urfalı bir anne-babanın çocuğu olarak Cizre'de doğdu (24 Şubat 1961). İlk ve orta öğrenimini Bursa'da tamamladı. İstanbul Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Türk Dili ve Edebiyatı bölümünden mezun olduktan sonra çeşitli yayınevlerinde editör olarak çalıştı. 1995-1996 arasında İzlenim dergisinin, 2000-2002 arasında da Da (Diyalog Avrasya) dergisinin yayın yönetmenliklerini yürüttü. Halen serbest yazar olarak çalışmaktadır.

Sosyal Bilimler Ansiklopedisi (Risale Yayınları, 4 cilt, İstanbul 198 ve Osmanlı Ansiklopedisi (Ağaç Yayıncılık, 7 cilt, İstanbul 1993) adlı çok ciltli çalışmaların yayın koordinatörlüklerinde bulundu. M. M. Şerif'in 4 ciltlik A History of Islamic Philosophy adlı edisyonunu, İslâm Düşüncesi Tarihi adıyla (İnsan Yayınları, İstanbul 1990-91) yayına hazırladı.

Türkiye Yazarlar Birliği tarafından 3 defa ödüle layık görüldü: Batı Düşüncesinde Dönüm Noktası (Fritjof Capra'dan, Tercüme dalında, 1989); Şehir, ey Şehir (Deneme dalında, 1997); Osmanlı: İnsanlığın Son Adası (Fikir dalında, 2003).

Telif kitapları şunlardır:

* Gelenek (1992)
* Gelenek ve Modernlik Arasında (1995)
* Şehir Asla Unutmaz (1996)
* Şehir, ey Şehir (1997)
* Bursa Şehrengizi (199 (2. baskı Osmanlı�yı Kuran Şehir adıyla (2006))
* Alev ve Beton (2000)
* İstanbul Mavi Kırpar Gözlerini (2003)
* Osmanlı: İnsanlığın Son Adası (2003)
* İnsan Yüzlü Şehirler (2004)
* Kuğunun Son Şarkısı: St. Petersburg�da Zamanlar ve Mekânlar (2004)
* Osmanlı�nın Kayıp Atlası (2004)
* Kır Zincirlerini Osmanlı (2004)
* Osmanlı Tarihinde Maskeler ve Yüzler (2005)
* Abdülhamid�in Kurtlarla Dansı (2006)
* Ufukların Sultanı: Fatih Sultan Mehmed (2006).
* Küller Altında Yakın Tarih (2006)
* Efsaneler ve Gerçekler (2007)
* Büyük Osmanlı Projesi (200

Çevirileri:

* Batı Düşüncesinde Dönüm Noktası (Fritjof Capra�dan, 1989)
* Molla Sadrâ ve İlâhi Hikmet (Seyyid Hüseyin Nasr�dan, 1991)
* Yeni Bir Düşünce (Fritjof Capra�dan, 1992)
* İslamın İlk Yılları (2001, Muhammed Esed�den)

Derlemeleri:

* İslam Bilimi Tartışmaları (derleme, 1990, İnsan Yayınları)
* İslam�da Bilgi ve Felsefe (1997)
* Düşüncenin Gökkuşağı: Cemil Meriç (2001)
* Tartışılan Sınırlar: Değişen Milliyetçilik (2001)
* İlber Ortaylı İle Tarihin Sınırlarına Yolculuk (2001)
* Küresel Kuşatma Karşısında İnsan (2004)
* Her Gün Bir Ediple (2004, Ahmet Refik Sevengil�in edebiyatçılarla söyleşileri)
* Bulutları Delen Kartal: Cemil Meriç ile Konuşmalar (2004, Sezai Coşkun ile birlikte)
* Osmanlı Geriledi mi? (2006)

Daha ayrıntılı bilgi için http://www.mustafaarmagan.com.tr